8月18日,学院国家动物免疫学国际联合研究中心王亚楠教授在《Nature Communications》(IF=18.1)发表了题为“Global genomic surveillance uncovers emergence and spatiotemporal patterns of World Health Organization priority antibiotic resistance in invasiveSalmonella”的研究论文。通过对7691株侵袭性沙门菌全基因组进行研究,该文揭示了70年来世界卫生组织(WHO)优先关注的临床关键抗生素耐药性的时空演变规律,为全球临床治疗指南制定和抗生素耐药性防控政策提供了重要的科学依据。

研究结果显示:7.39%的菌株对环丙沙星耐药或敏感性降低,涉及29个国家(占37.7%)。亚洲耐药率最高(11.79%),其中中国为8.86%。7.91%的菌株对3GCs耐药或敏感性降低。共检测到16种blaCTX-M变体,其中最优势的是blaCTX-M-15(3.48%),其次是blaCTX-M-55(0.88%)和blaCTX-M-65(0.82%)。南美洲耐药率最高(17.12%),其次为欧洲(14.73%)和亚洲(11.14%)。7.27%的菌株对头孢吡肟耐药。0.79%的菌株对阿奇霉素耐药,呈上升趋势。欧洲(1.55%)和亚洲(1.44%)耐药率较高。0.26%的菌株对黏菌素耐药。0.10%的菌株对美罗培南和亚胺培南耐药。环丙沙星耐药率从0.21%升至2020–2024年的18.42%。伤寒沙门菌、肠炎沙门菌、婴儿沙门菌和猪霍乱沙门菌是这一上升趋势的主要贡献者。第三代头孢菌素耐药率从0.21%攀升至17.01%,第四代头孢菌素耐药率从2.87%升至16.85%。主要贡献为伤寒沙门菌(ST1和ST2)、肠炎沙门菌ST11、都柏林沙门菌ST10、肯塔基沙门菌ST198和鼠伤寒沙门菌ST313。
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王亚楠教授与上海市疾病预防控制中心许学斌教授为论文共同通讯作者。丝袜av
王亚楠教授课题组研究生裴宇航和杨子茹为论文共同第一作者。丝袜av
为第一完成单位。中国科学院微生物研究所(高福院士、朱宝利研究员)、南宁市第四人民医院(厐晓泸)、新疆维吾尔自治区疾病预防控制中心(夏依旦)、厦门市儿童医院(黄美恋)、山西省儿童医院(孟晋华)、福建省疾病预防控制中心(邱玉峰)、广西壮族自治区疾病预防控制中心(王鸣柳)、山西省疾病预防控制中心(杨红霞)、重庆医科大学附属儿童医院(景春梅)、复旦大学附属儿科医院(曾玫)、上海市浦东新区疾病预防控制中心(王闻卿)、上海市疾病预防控制中心(刘玥)、上海市闵行区疾病预防控制中心(周毅彬)等参与指导了本研究。研究得到河南省青B、国家重点研发计划、河南省联合基金青年科学家和丝袜av
高层次人才等项目的资助。
链接://doi.org/10.1038/s41467-026-76354-1。
8月18日,学院国家动物免疫学国际联合研究中心王亚楠教授课题组在《Microbiological Research》(IF=8.5)发表了题为“Genomic epidemiology of clinically critical antibiotic resistance inSalmonella entericacausing bloodstream infections across six Chinese provinces, 1994–2023”的研究论文。通过对1994年至2023年间中国六个省的833株血流感染沙门菌进行研究,从基因组流行病学角度揭示了临床关键抗生素耐药在沙门菌中的长期演变趋势、区域差异与高危人群特征。这一成果为血流感染的临床治疗指南制定、抗生素管理政策优化以及耐药监测网络建设提供了重要的数据支撑。

研究揭示了过去30年间中国沙门菌血流感染的显著血清型变迁;发现我国6个省区血流感染沙门菌临床重要抗生素耐药不容乐观,在833株分离株中,8.52%对环丙沙星耐药或敏感性降低,4.32%和6.84%分别对第三代和第四代头孢菌素耐药或敏感性降低,2.16%对阿奇霉素耐药。总体而言,阿奇霉素和磷霉素耐药率正在上升,环丙沙星、第三代和第四代头孢菌素的敏感性降低或耐药性同样呈现增长趋势。研究团队还将833株新测序数据与991个来自不同宿主(包括人、动物、食品和环境来源)的公开基因组进行了整合分析,在“同一健康”框架下探索沙门菌的遗传关联。这一方法有助于揭示抗生素耐药基因在人类、动物和环境之间的传播路径,为从源头遏制耐药性扩散提供了科学依据。
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王亚楠教授与上海市疾病预防控制中心许学斌教授为论文共同通讯作者。丝袜av
王亚楠、王亚楠教授课题组研究生裴宇航、上海市疾病预防控制中心许学斌、南宁市第四人民医院厐晓泸、新疆维吾尔自治区疾病预防控制中心夏依旦、厦门市儿童医院黄美恋、山西省儿童医院孟晋华为论文共同第一作者。丝袜av
为第一完成单位。中国科学院微生物研究所(高福院士、朱宝利研究员)、福建省疾病预防控制中心(邱玉峰)、广西壮族自治区疾病预防控制中心(王鸣柳)、山西省疾病预防控制中心(杨红霞)、重庆医科大学附属儿童医院(景春梅)、复旦大学附属儿科医院(曾玫)、上海市浦东新区疾病预防控制中心(王闻卿)、上海市疾病预防控制中心(刘玥)、上海市闵行区疾病预防控制中心(周毅彬)等参与指导了本研究。研究得到河南省青B、国家重点研发计划、河南省联合基金青年科学家和丝袜av
高层次人才等项目的资助。
论文链接://doi.org/10.1016/j.micres.2026.128691。
8月11日,学院国家动物免疫学国际联合研究中心王亚楠教授课题组在《BMC Microbiology》(IF=5.4)发表了题为“Phenotypic and genomic characteristics ofSalmonellaisolates from 99,780 wet market workers in Shanghai”的研究论文。通过对上海99780名农贸市场从业人员进行了沙门菌携带情况筛查,揭示了这一职业群体中沙门菌的无症状携带率、耐药特征及基因组学特点。

研究团队于2023年6月至12月,对上海市崇明、浦东、嘉定、普陀、松江、宝山六个区的99780名农贸市场从业人员的粪便样本进行了筛查。结果显示,共分离出116株沙门菌,总体携带率为0.12%。优势血清型为鼠伤寒沙门菌单相变种(占18.10%)、伦敦沙门菌(占14.66%)和哈瓦那沙门菌(占9.48%)。药敏结果显示,对第三代头孢菌素类药物的耐药率为17.24%(头孢噻肟)和10.34%(头孢他啶),对环丙沙星的耐药率为11.21%,对阿奇霉素的耐药率达14.66%。碳青霉烯类(美罗培南)、多黏菌素类(多黏菌素B)等最后防线抗生素的耐药率介于4.31%至8.62%之间。进一步分析发现:在两株鼠伤寒单相变种沙门菌分离株中检出了质粒介导的替加环素高水平耐药基因tet(X4)。
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王亚楠教授与上海市疾病预防控制中心许学斌教授为论文通讯作者。王亚楠教授课题组研究生杨子茹与上海市闵行区疾病预防控制中心周毅彬教授为论文共同第一作者。丝袜av
为第一完成单位。研究得到河南省青B、联合基金青年科学家、国家重点研发计划及丝袜av
高层次人才等项目资助。
论文链接://doi.org/10.1186/s12866-026-05511-9。
以上成果是研究团队在2023年National Science Review揭示中国沙门菌优势血清型演变规律、2023年Microbiology Spectrum发布首个开源的中国沙门菌基因组数据库、2025年Nature Communications发布百年沙门菌耐药遗传图谱、2025年Communications Medicine揭示闵行区10年沙门菌耐药特征、2026年Food Safety and Health揭示沙门菌阿奇霉素耐药特征后,在耐药沙门菌研究中的又一系列重要成果。(文/杨子茹)
通讯作者简介:王亚楠,丝袜av
高层次人才、校级特聘教授、博导/硕导,丝袜av
国家动物免疫学国际联合研究中心张改平院士团队成员。主要研究方向为微生物组与耐药基因组、人兽共患病、病原微生物耐药与防控。主持河南省青B、联合基金青年科学家等项目。以第一或通讯作者(含共同)在Science(2026)、Nat Commun(2026;2025,ESI高被引、热点论文)、Adv Sci(2026)、Microbiol Res(2026)、J Hazard Mater(2025)、Natl Sci Rev(2023,ESI高被引)等期刊发表20多篇学术论文。