中国地处东亚—澳大利西亚、中亚和西亚—东非等重要候鸟迁徙路线的交汇区，是候鸟停歇、繁殖和越冬的关键区域。然而，候鸟在长途迁徙过程中，也成为了微生物乃至耐药基因的携带者和传播者。
      研究团队整合分析52种鸟类的宏基因组测序数据，组装获得了5823个高质量MAGs，其中约50%的MAGs未被描述过，覆盖36个门、1709个潜在新物种，拓展了我们对候鸟携带“微生物暗物质”的认知。在功能基因挖掘方面，预测到15678个次级代谢产物生物合成基因簇（BGCs），其中核糖体合成肽类（RiPPs）和非核糖体肽合成酶类（NRPS）最为丰富，为新型抗菌肽和天然产物的开发提供了重要数据资源。
      研究团队在候鸟肠道微生物中识别出1814种抗生素耐药基因，绘制了52种鸟类的耐药基因图谱，包括碳青霉烯、多黏菌素、替加环素和恶唑烷酮等优先药物耐药基因，耐药基因的跨物种、跨区域（大洲、国家）、跨生境的传播风险严峻。

 

图 候鸟跨境迁徙路线图

      研究团队为10种鸟类佩戴了GPS追踪器，累计获取超过10万个高精度定位点。追踪数据显示，这些候鸟从云南等地，向北迁徙至俄罗斯、蒙古，或向西进入印度、孟加拉国、缅甸等地，途经中国江西、河南、黑龙江、新疆、青海、西藏、内蒙古、甘肃、宁夏等多个省份。
      该研究范围覆盖中国11个省份、52种鸟类，核心价值在于多生态位、多鸟种、多年度尺度上构建的大规模迁徙候鸟微生物组参考数据集，填补了中国跨境迁徙候鸟微生物参考基因组和基因集研究盲区，构建的MBGG目录将成为全球科研人员挖掘候鸟微生物资源“暗物质”、研究耐药基因传播机制和评估公共卫生风险的重要工具。
      丝袜av 国家动物免疫学国际联合研究中心王亚楠（丝袜av 高层次人才、特聘教授、博士生导师/硕士生导师）为论文唯一通讯作者，丝袜av 国家动物免疫学国际联合研究中心为第一完成单位。王亚楠与中国科学院昆明动物研究所（遗传进化与动物模型全国重点实验室）伍和启为论文共同第一作者。中国科学院微生物研究所高福院士、朱宝利研究员、毕玉海研究员，中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所徐子乾副研究员，上海市疾病预防控制中心许学斌教授等参与指导了研究。该研究得到了国家重点研发计划、丝袜av 高层次人才、中国科学院生物多样性监测与研究网络-鸟类专项等项目的资助。
      论文链接：//advanced.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/advs.74581